Förlorad i bioinformatikens värld

Ge mig ett intressant problem och jag bara måste hitta svaret!

Det blev ingen gelkörning idag för vi hade inga "bakade" E-kolvar. Ja, det är precis som det låter: man bakar kolvarna i 200 grader i 4 timmar i en ugn för att ta död på allt som kan kontaminera proverna. :o) Så när jag renat klart RNA från den sista hästen gav vi, min handledare och jag, oss på att designa primrar för ett av enzymerna vi jobbar med. De har försökt få fram bra primrar till det här enzymet två gånger tidigare, men inget av primerparen har fungerat.

Jag fick lite hjälp att komma igång eftersom det är lite speciellt att designa primrar för realtids-PCR och mRNA istället för DNA. Dessutom är enzymet vi vill titta på inte lokaliserat i hästgenomet så då får man ta lite omvägar för att, förhoppningsvis, komma rätt. Arbetet resulterade i alla fall i ett primerpar som ser lovande ut. Imorgon ska jag läsa in mig lite mer på enzymet och om saker verkar stämma skickar vi in beställningen på måndag. :o)

Innan min handledare gick för dagen gav hon mig sekvenserna för de gamla primerparen, som inte fungerat, och bad mig försöka klura ut varför de inte hade fungerat. Gaaah, man ger inte något sånt till mig innan jag slutar! Jag var tvungen att sitta kvar tills jag kommit fram till en potentiell lösning. Nu återstår bara att se vad min handledare har att säga om mitt resonemang!

Nu ska jag bege mig in till stan för att köpa någon form av inneskor att ha på labbet och sedan äta middag med M och Jess. Inte för att mat är spciellt lockande just nu.. Det smakar verkligen ingenting och om det inte är gott känns det helt värdelöst att äta. Dessutom är jag sur för att jag inte kan rida och springa!